Datavitskap med R for medisinske forskarar
Ph.d.-kurs
- Studiepoeng
- 3
- Undervisningssemester Haust
- Emnekode
- RMED901A
- Talet på semester
- 1
- ±«²Ô»å±ð°ù±¹¾±²õ²Ô¾±²Ô²µ²õ²õ±è°ùÃ¥°ì
- Engelsk
- Ressursar
Emnebeskrivelse
MÃ¥l og innhold
Emnet har som mål å gi grunnleggande kunnskap for effektiv handsaming av forskingsdata, og gjennomføring av forskingsprosjekt.
Emnet skal formidle: forståing av basis programmeringskunnskap; oppretting av klare, reproduserbare analyseplanar; moderne retningsliner for digital administrering av prosjekt; smart bruk av IKT-infrastruktur; deling av kode/data.
Innhald:
- Grunnleggande programmering (R)
- Tidyverse
- Analyse av medisinske data
- Visualisering (ggplot2)
- Versjonskontroll
- Grunnleggande dokumentasjon
- Deling av kode/data
Kurset går i haustsemesteret.
³¢Ã¦°ù¾±²Ô²µ²õ³Ü³Ù²ú²â³Ù³Ù±ð
Etter at kurset er gjennomført skal kandidaten ha følgande læringsutbytte definert i form av kunnskapar, ferdigheiter og generell kompetanse:
Kunnskapar
Studenten:
- kan skille mellom R, RStudio og R-pakkar, og beskrive skilnadane mellom desse
- kan forklare steg i utforskande dataanalyse og kvifor ein gjer dette
- kan gje døme på strukturert og utforma "ryddig" data ("tidy data")
- forstår kvifor og kan forklare korleis ein bruker versjonskontroll
- kan identifisere fleire visualiseringsmetodar som er ofte brukt i dataanalyse
- kan gje døme på reglar for personvern og datadeling innan medisinsk forsking
Ferdigheiter
Studenten:
- kan bruke grunnleggande R-kommandoar for å mate inn og granske data
- kan omstrukturere datasett ved hjelp av tidyverse R-pakken
- kan lage grafar og figurar ved hjelp av ggplot2 R-pakken
- kan bruke versjonskontrollprinsipp på eigne forskingsprosjekt
- kan dokumentere filene, kodane og mappene i eigne prosjekt
Generell kompetanse
Studenten:
- kan foreslå naudsynte steg for gjennomføring av "tidy data analysis"
- kan velge visualiseringsmetodar som passar best avhengig av datatypen, mål for visualisering, og publikum
- kan lage dataanalyseplan
- kan lage ein rapport i .html, Word eller PDF, som summerer arbeidet sitt
Studiepoeng, omfang
Studienivå (studiesyklus)
Undervisningssemester
Undervisningssted
Krav til forkunnskaper
Anbefalte forkunnskaper
- Har prøvd å skrive eller å lese eit skript
- Har prøvd dataanalyse - sjølv om ein kun har prøvd to kommandoar og det var mislykka!
- ForstÃ¥r det er vanskeleg Ã¥ forstÃ¥ andre sine skript/programÂ
- Det er ikkje nausynt med forkunnskap om R, men det er eit pluss
Studiepoengsreduksjon
Krav til studierett
Arbeids- og undervisningsformer
Obligatorisk undervisningsaktivitet
Vurderingsformer
I emnet nyttar ein følgande vurderingsformer:
- Gruppeprosjekt
- Gruppene blir oppretta i starten av kurset og gruppearbeidet under heile kurset blir ein viktig del av sluttprosjektet.
- Dokumentasjonen vil bli utarbeida individuelt av medlemmene i gruppa for å vise individuell framgang, og vil bli evaluert parallelt med gruppeprosjektet.
°¿±è±è³¾Ã¸³Ù±ð
Karakterskala
Vurderingssemester
Litteraturliste
Emneevaluering
Programansvarlig
Emneansvarlig
Institutt for global helse og samfunnsmedisin
Julia Romanowska og Janne Mannseth
Administrativt ansvarlig
Institutt for global helse og samfunnsmedisin
Kontaktperson: