Øystein Eikrem leder banebrytende forskning på nyrene. Svaret kan ligge i KI-teknologi.
Et dypdykk i biologien kan gjøre det mulig Ã¥ forutse hvilke pasienter med kronisk nyresykdom som vil fÃ¥ et alvorlig forløp og ikke. Førsteamanuensis Øystein Solberg Eikrem ved ºÚÁϳԹÏ×ÊÔ´ leder forskningen som kan bli vendepunktet for pasienter med sykdommen «IgA nefropati».
Publisert: (Updated: )
IgA nefropati (IgAN) er den vanligste Ã¥rsaken til kronisk betennelse i nyrenes karnøster bÃ¥de i Norge og i resten av verden. Diagnosen stilles med vevsprøve fra nyren. Â
IgAN rammer ofte unge voksne og kan ende i alvorlig nyresvikt med behov for nyretransplantasjon eller dialysebehandling. Ifølge Tidsskrift for den norske legeforening fÃ¥r i overkant av 100 personer denne diagnosen i Norge hvert Ã¥r.Ìý
– Dette er en autoimmun sykdom som angriper nyrene og som kan endre folks liv dramatisk, forteller Øystein Solberg Eikrem.Ìý
Tverrfaglig tilnærming
Han leder Nyreforskningsgruppen ved Klinisk institutt 1, Det medisinske fakultet. Gruppen bestÃ¥r av et tverrfaglig miljø av bÃ¥de biologer og klinikere, som muliggjør tett kobling mellom molekylære analyser og kliniske problemstillinger.Ìý
Gruppen har et nært samarbeid med Nyreseksjonen ved Haukeland universitetssykehus (HUS), ledet av Thomas Knoop, samt med nefropatolog Sabine Leh ved patologiavdelingen. Dette er en styrke for integrasjonen mellom forskning, klinikk og diagnostikk.Ìý
Eikrem er også i siste søkandsrunde i konkurransen om å motta et fra Det europeiske forskningsrådet. ERC Starting Grant er en prestisjefylt EU-finansiering for unge forskere som vil bygge sin egen forskningsgruppe og gjennomføre et ambisiøst, nyskapende prosjekt. Ordningen støtter tidlig karriereutvikling og gir betydelige midler til å etablere en selvstendig forskningsretning.
Vet lite om sykdomsforløpetÂ
Forskningsprosjektet «Spark-IGAN» skal ta i bruk splitter ny teknologi ved Ã¥ utvikle en helt ny, molekylær forstÃ¥else av sykdommen. Skattekisten er Norsk nyreregister. Dette registeret inneholder vevsprøver fra 19.000 norske pasienter med nyresykdom og over 2000 pasienter med IgANÂ
Problemet i dag er at legene mangler gode verktøy for å forutsi hvem som vil få rask sykdomsforverring og hvem som kan leve lenge med stabil sykdom. Diagnosen baseres fortsatt på mikroskopi av nyrevev og enkle blod- og urinprøver, som ikke klarer å fange opp den store variasjonen mellom pasienter.
– I praksis gjør vi et dypdykk i biologien. Ved Ã¥ kartlegge hvilke gener som er aktive i helt bestemte omrÃ¥det av nyrevevet, kan vi finne ut hvilke celler som styrer hvilke genuttrykk, forklarer Eikrem.ÌýÂ
Et «Google maps» for cellerÂ
Teknologien som benyttes kalles «spatial transcriptomics» pÃ¥ fagsprÃ¥ket. Den gjør det mulig Ã¥ sekvensere alle gener i et vevssnitt, samtidig som man fÃ¥r informasjon om hvor i vevet disse genene uttrykkes. Eller hvordan cellene opererer, om du vil.Ìý
Denne avlesningen genererer svært store datamengder og deler av analysene kan gjøres av avanserte KI-modeller. KI-modellene kan også oppdage mikroskopiske mønstre i vevsbilder som er for små til at en patolog kan oppdage dem.
– For pasientene vil det bety at vi kan se pÃ¥ genuttrykket for Ã¥ finne en molekylær profil som igjen kan fortelle oss om det vil gÃ¥ bra eller dÃ¥rlig med pasienten.Ìý
Presisjonsmedisin er mÃ¥letÂ
NÃ¥r forskerne har funnet en ny genprofil, kan de ogsÃ¥ vurdere hvilke medisiner som kan settes inn for Ã¥ virke spesifikt mot mekanismene som driver sykdommen framover. Dette kan ogsÃ¥ være medisiner som egentlig brukes pÃ¥ andre tilstander (pÃ¥ engelsk kalt «repurpose», eller gjenbruk pÃ¥ norsk). Â
Personer som i dag fÃ¥r konstatert nyresykdom fÃ¥r som regel nyrebeskyttende tiltak i form av blodtrykksmedisin, kolesterolsenkende tabletter og i noen tilfeller immundempende behandling. Men i likhet med f. eks en del kreftbehandlinger, er det ofte ikke snakk om persontilpasset behandling.Ìý
– Det pÃ¥gÃ¥r mange kliniske studier pÃ¥ mer spesifikke typer behandling, det vi gjerne kaller presisjonsmedisin. Nyreforskningsgruppen har ogsÃ¥ publisert tre doktorgrader med langtidsdata pÃ¥ denne sykdommen. Vi ser at det er et veldig variabelt sykdomsforløp innenfor samme sykdomsgruppe, sier Eikrem. Â
Har mottatt god søknadsstøtteÂ
Ã… søke et ERC Starting Grant er en omfattende og tidkrevende prosess.Ìý
Eikrem har opplevd støtteapparatet bÃ¥de pÃ¥ fakultetet og sentraladministrasjonen ved ºÚÁϳԹÏ×ÊÔ´ som veldig verdifullt i denne prosessen.Ìý
– De har hjulpet med alt det administrative rundt, for eksempel Ã¥ sette opp budsjett. Skulle jeg være sÃ¥ heldig Ã¥ motta det, sÃ¥ ville det være en voldsom dørÃ¥pner. Vi har allerede flere internasjonale samarbeidspartnere i vÃ¥r gruppe. Det ville ogsÃ¥ kunne skape mer oppmerksomhet internasjonalt rundt vÃ¥r forskning, sier Eikrem.Ìý